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2023年4月27日,食品加工过程食源性致病菌监测与控制技术网络研讨会顺利举行。由华大智造支持的测序专题中,邀请中国疾病预防控制中心传染病预防控制所研究员周海健、华大智造中国区产品高级经理徐媛做了主题报告。
周海健研究员带来了“基因测序技术在病原菌感染鉴定和分型溯源中的应用”的报告。 周老师在报告中提到:“随着社会的发展、生产生活方式以及生态环境的变化,重大新发传染病的发生风险始终增加。当前我国细菌性传染病的防控,仍然面临众多挑战,包括传统细菌性传染病依然肆虐、新发细菌性疾病不断出现、细菌耐药危害十分严重以及对动物及环境相关病原菌认识和监测严重不足。”左右滑动查看更多
推进细菌性传染病实验室病原学监测和病原学预警技术的应用,能够更好应对当前传染病防控面临的挑战。我国已经初步建立了基于国家致病菌识别网的细菌性传染病实验室监测预警体系,并应用于常规监测。其中,高通量测序技术是提升突发公共卫生疫情发现能力的关键技术,促使临床症状发现疫情向病原序列发现疫情转变。同时,高通量测序技术也促进疫情溯源能力提升到新的高度。基于高通量测序,不仅可以通过序列直接比对开展点状暴发溯源;而且基于群体遗传学原理可以实现跨地区和跨宿主溯源,甚至可以通过“累积点突变”分析揭示传播链;另外,通过对细菌耐药性和耐药元件监测,可以及时发现具有公共卫生意义的耐药克隆和耐药性跨种属传播扩散。华大智造徐媛博士分享了题为“华大智造DNBSEQ-G99高通量测序仪加速微生物鉴定和研究”的报告。
徐媛博士提到,高通量测序技术在微生物鉴定分型性能、使用成本、检测速度、方法通用性、操作便捷性、数据标准化等方面有着不可替代的优势,能够为公共卫生以及食品、饲料和药品的生产管理提供决策支持,提高参与全球贸易的信心。
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目前越来越多的微生物测序数据的发布和共享,助力了食源性致病菌精准鉴定和溯源。国际上美国FDA GenomeTrakr网络已经测了超过100万株食源性致病菌同时完成了500个菌株完成图。中国国家食品安全风险评估中心也建成了“基于WGS分型技术的食源性疾病分子溯源网络”,在我国食源性病原菌监测和爆发调查工作中发挥重要的作用。 DNBSEQ-G99被称为“速度王者”,PE150测序仅需12个小时,SE100测序5个小时内即可完成。同时,G99也极具简单性和灵活性,双载台设置、双模运行模式、全新的卡式测序载片和一体化的测序试剂盒,可全面解放双手,为客户带来更佳测序体验。结合华大智造全流程产品组合,覆盖核酸提取、文库构建、测序和生信分析过程,可为微生物测序提供高准确性、高灵活性、可拓展性的全流程自动化方案。 · ·X 关闭
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